熊本縣從古代以來就一直是九州的行政、文化、交通、經濟的據點而發展至今。不僅處在良好的地理位置，還展現著肥後悠久的歷史與傳統氣息，已因是日本屈指可數的文化縣而受到世人認可。熊本縣還擁有聞名世界的兩大旅遊勝地阿蘇、天草，還有富有自然韻味的風景都吸引著每個人的心神；有保存著相良氏700年風貌的人吉、球磨地區、在綠川流域有散佈著被稱為石藝術品的石橋、還有蘆北地區那令人神往的沈穩而美麗的海濱等，都的確值得一覽。

　　從縣內各地發現的歷史遺跡來推斷，從約1萬5千年前開始就有人在這裏居住。其後在有明海、不知火海所流經的河川流域、天草島等縣內各地約800個地方發現了西元前7000年左右至西元前200年左右約6000-7000年的繩文時代的遺跡。

　　西元前2-3世紀彌生的農耕文化開始產生，在其遺跡玉名郡天水町發掘出我國最早的鐵斧，這說明了從那時起金屬器就傳入這裏了。

　　進入古墳時代，除城南町、宇土半島分佈著古式的古墳群以外，以阿蘇谷、菊水町、鹿央町等地為中心的前方後圓的古墳群發展起來了，6-7世紀日本為數不多的裝飾古墳文化在菊池川流域繁榮起來了。這個時期，縣內出現了火國、阿蘇國、天草國等小國，不久被火國（或肥國）、肥後國所統一。大化改新後，根據國郡制，肥後國也置國府，在大宰府的管轄下國司進行政治統治。

　　進入平安時代，肥後國出現14個郡，共有99鄉。

　　進入平安中期以後莊園全盛的時代，縣內出現了阿蘇莊、鹿子木莊、山鹿莊等數十個大莊園，到了平安末期，這些莊園中開始興起了武士團。不久鐮倉幕府完成統一後，武士們被任命為莊園主或保護人，在各莊園勢力不斷擴大。其中除了阿蘇氏、菊池氏等本地豪族以外，人吉的相良氏、玉名的小代氏等成立幕府後，也有一部份是從遙遠的其他地方來這裏赴任的。

　　南北朝時菊池氏的勢力強大起來了，阿蘇、名和、相良等諸氏的勢力繼續維持下來，室町末期菊池氏開始衰弱，這時，豐後的大友氏、肥前的龍寺氏、薩摩的島津氏的勢力增強，肥後成了戰國三大名爭奪的地區。以後一直到豐臣秀吉平定九州為止，這裏都是島津氏的勢力。